一文学会Harmonizonme和hTFtarget数据库使用方法
嗨，小伙伴们大家好！这里是每周一弘毅专栏，我志向用小小文字助力你的SCI发表之路。接上周话题，转录因子相关课题经常遇到的两个问题，一是已知靶基因寻找它上游的转录因子？二是已知转录因子寻找它可能的靶基因？前一个问题上周已经给大家做过演示，本周针对第二个问题给大家介绍Harmonizonme和hTFtarget数据库，跟着弘毅的脚步一起来看看吧~！
前情提要
1.转录因子相关名词
DBD(DNA binding domain)
TFBS(ranscription factor binding site)
Target genes
2.转录因子结合位点预测
JASPAR
NCBI
UCSC数据库
Harmonizonme数据库
数据库概览
进入Harmonizonme主页(https://maayanlab.cloud/Harmonizome/)，点击About可见数据库简介，于2016年发布，目前收录来自66个在线数据库的114个基因组学、转录组学、蛋白质组学和代谢组学数据集，着重于定义基因和不同属性之间的关联，属性可以是基因、蛋白质、细胞系、组织、实验干预因素、疾病、表型或药物，并构建基因与基因和属性与属性的相似性网络。本文重点介绍转录因子和靶基因数据集。
功能及操作演示
转录因子靶基因预测，进入Harmonizonme主页，点击SEARCH进入检索界面，下拉菜单选择Database，检索框输入transcription factors targets，回车得到14条检索结果，前6个为转录因子靶基因数据库。